Gastroprojekt primjenjuje ISO standarde u svom poslovanju, te je primio Certifikate za sustave upravljanja prema ISO 9001:2015 i ISO 14001:2015.
Norma ISO 14001 predstavlja zahtjeve koji se odnose na sustav upravljanja okolišem, a podrazumijeva planiranje, uspostavu, primjenu i nadzor sustava upravljanja okolišem.
ISO 9001 pruža garanciju da su svi procesi i usluge realizirani prema zahtjevima sustava upravljanja kvalitetom.